Skotlanti 1930-luvulla. 8-vuotias Kirstie ja hänen 5-vuotias pikkuveljensä Angus löytävät kotirannaltaan erikoisen munan. He vievät sen kotiin, ja munasta kuoriutuu kummallinen, pitkäkaulainen suomukas eläin. Koko perhe kiintyy nopeasti tähän sympaattiseen ja leikkisään kaveriin. Eläin kasvaa kuitenkin huimaa vauhtia, ja lopulta se on siirrettävä läheiseen järveen. Mutta eläimen olemassaolo on ehdottomasti salattava muilta...
Vesihevonen on lämmin kuvaus eläimen ja ihmisen ystävyydestä.